在推行6S管理的过程中，有些员工认为有些资料只有自己一个人使用，所以没必要整理。实际上请假、出差等特殊事件都可能发生工作移交的情况。因此，共用部分的资料应当整理到科室资料架，个人部分的资料既可以整理到科室资料架，也可以整理到个人资料架，但必须公开并按照要求进行标识。在公司推行和实施6S咨询管理的过程中，公司所遇到的主要问题或困难是：
　　1、各级人员对6S的理解和认识不足
　　6S看似简单，6S的定义也简单明了，可是实际内容却包含了企业生产经营各个层面。大多管理人员对6S的理解仅仅局限于表面的整理整顿与清扫上．因为缺乏实际经验，造成对6S的深入方面欠缺理解。
　　另一方面，6S实施能给各级人员带来减少日常工作量的好处，比如寻找物品的时间减少，换产速度的提高，不良品的减少等等。都可以帮助企业员工减少日常不必要的工作量．但是在初期，需要补课做好整理、整顿、清扫等工作，当时是增加了人员的工作量，需要让所有人员理解和认真执行6S咨询管理的相关规定，用每天有章可循的6S工作，换来长期效率的提高。

2、管理成本要增加
　　6S管理的应用必须投入一定的人力、物力、财力、时间等，对此企业领导和部门主管必须有一定的思想准备和行动表率。
　　3、需要反复推动
　　6S管理和开展活动有一些程式化的东西，容易引起员工的厌烦，同时需要不停的反复推动。效果和作用才能保持，因为这是一种重复性的工作，对任何一个人，当重复工作的时候，都可能会产生一些不良的情绪，或者烦躁，所以容易虎头蛇尾，不容易持久做好。公司应针对上述问题，也在进一步研究对策，努力克服困难，减少其负面影响，逐步解决，以实现6S咨询管理应用的持续推进和不断完善。
　　4、员工队伍变化快
　　由于目前企业劳动用工制度的变化，公司的员工主体已经变成为来自农村的年轻人．人员的流动性也在逐年增大，这些人员在入厂后，就必须接受专门的6S管理培训，对新员工的6S管理培训工作就公司一项长期的任务，耗费时问，同时客观上也影响了6S管理的实施效果。